En primer lugar, hay una ligera ambigüedad en su pregunta. Por “Maestría en Electricidad e Informática”, ¿quieres decir ingeniería eléctrica e informática o ingeniería eléctrica o informática? Estoy respondiendo esta pregunta suponiendo que se trata de Ingeniería Eléctrica e Informática, no de Ciencias de la Computación. Tampoco mencionó sobre su área de especialización prevista, por ejemplo, si es VLSI o Sistemas Embebidos, o Arquitectura de Computadora Avanzada, etc., así que asumo que lo haría estar relacionado con ECE o ingeniería informática.
Las certificaciones no agregarán mucho a sus posibilidades de obtener una admisión (al menos para las buenas universidades), aunque pueden ser útiles cuando solicite trabajos a tiempo parcial o ayudantes. Cuando tienes un título de ECE, no creo que seas completamente inadecuado para los programas de maestría en ingeniería eléctrica e informática. Puede solicitar programas de ingeniería informática o programas relacionados con ECE y luego tomar algunos cursos de ingeniería informática. Recuerde que Computer Science es diferente de la ingeniería informática, y para un estudiante de ECE es difícil ingresar a los programas de CS pero relativamente más fácil ingresar a los programas de CE. Si está solicitando para el otoño de 2016, entonces tiene buen tiempo para hacer algunos proyectos para que pueda mencionarlos en su SOP. Los proyectos relacionados o cercanos a su especialización prevista serían una ventaja definitiva en lugar de algunos proyectos vagos no relacionados. Recuerde que tener un proyecto XYZ java no significa que tenga una formación en ciencias de la computación significativa (a menos que esté trabajando en una empresa de productos de primera clase o buenas nuevas empresas donde desarrolle algoritmos, etc.). La informática es mucho más que solo la programación JAVA. Entonces, a menos que tenga una buena experiencia laboral relacionada, los proyectos relacionados con su especialización prevista son mucho mejores que los proyectos JAVA de ejecución de fábrica.