Me ofrecieron un asiento en matemáticas Msc en el campus de Bits Pilani Goa en la primera iteración. ¿Puedo inhabilitar mis preferencias más altas? Si es así, ¿cómo es eso?

No puedes.
Sin embargo, cuando se presente en el campus (después de la tercera iteración), se le dará la opción de bloquear el campus. Eso cancelará todas las opciones superiores de otros campus.
Por ejemplo: su lista de preferencias es:
A2P
A1P
A2G
A1G
B2P
B1P
B2G
B1G

Donde AX / BX representa el código de sucursal y P / G representa los campus de Pilani y Goa.
Ahora, si tienes B2G en la tercera iteración, tienes la opción de bloquear. Si elige bloquear, su nueva lista será:

A2G
A1G
B2G (Tienes esto)
B1G

Lo que podría pasar es que podrías terminar con A1G o A2G. Pero no obtendrás nada de otros campus.

La mejor manera de evitar este problema es completar siempre sus preferencias de acuerdo con sus preferencias. Eso es difícil porque tienes que completar tus preferencias antes de saber nada sobre los cursos.

No. Lo siento, eso no es posible. Si tiene preferencias más altas, se considerarán en cada iteración, le guste o no. Se menciona en las modalidades.