Como ya mencionaron otros, depende en gran medida de sus intereses. Sería bueno pasar por las descripciones de los programas tanto para MS como para MIS para varias universidades, buscando la duración y los cursos ofrecidos. También puede buscar en la web los perfiles de trabajo que se ofrecen a los graduados de ambos programas. Esto debería darle una idea justa de cuál es la mejor opción para usted.
Estas son algunas cosas que he llegado a saber por experiencia personal:
1. Su experiencia laboral tendrá mayor importancia si solicita MIS.
2. Se le ofrecerán más puestos de orientación gerencial después de MIS y más orientación técnica después de MS. Esta es una generalización; depende significativamente de la estructura del programa y de los cursos elegidos.
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3. MIS generalmente cuesta más que MS, ya que es un programa de grado profesional.
4. Muchas universidades ofrecen especializaciones en el programa de MS. Considérelos si está inclinado hacia algún campo en particular, por ejemplo, Minería de datos.
5. En general, cada vez que MIS es ofrecido por la escuela de tecnología / ingeniería / ciencias de una universidad, tiende a ofrecer más cursos de ciencias de la computación en lugar de ser ofrecido por una escuela de negocios.
Acerca de los colegios / universidades objetivo, es mejor decidir primero a qué programa desea postularse o al menos decidir si desea que sea técnico o no técnico.
Avíseme si necesita alguna aclaración.