Es lo mismo que poner un imán normal bajo el agua.
Creo que no habrá mucha diferencia en el campo magnético.
Básicamente, la fuerza entre dos imanes depende de qué tan separados estén y en qué ángulos estén girados. Por supuesto, si hay algo más alrededor, que está ejerciendo fuerzas sobre los imanes, puede perder la noción de la fuerza directa entre ellos.
Por ejemplo, si hay una pieza de hierro entre ellos. Magnetizan el hierro, por lo que ahora hay otro imán alrededor. El hecho de que haga que la fuerza neta sobre cada imán sea más grande o más pequeña depende de cómo estén dispuestos y de la conductancia del material entre ellos.
Dado que el agua es casi completamente no magnética, simplemente no genera ninguna fuerza magnética adicional significativa en los imanes. Todo lo que obtienes es la misma fuerza que habría habido si estuvieran en el aire o en el vacío.
Explicación más elaborada aquí:
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